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Research area: KBBE-2009-1-1-02 Mining genomics information of small ruminants to generate understanding of the genetic basis of phenotypes important to sustainable production and health
The 3SR project (Sustainable Solutions for Small Ruminants) brings together a strong and unique international consortium of 14 partners that will mine genomic information of sheep and goats to deliver a step-change in our understanding of the genetic basis of traits underlying sustainable production and health. To do this we will build on existing research resources in the major sheep and goat producing member states to discover and verify (in commercial populations) selectable genetic markers (and causative mutations where possible) for traits critical to sustainable farming, particularly in marginal areas. The targeted sustainability traits are mastitis susceptibility, nematode resistance and ovulation rate. These are traits that would markedly benefit from genetic markers, and traits for which we have evidence that polymorphisms exist with large effects on trait variation. We will apply the latest high-throughput genomics technologies, comparative and functional genomics; together with targeted genome sequencing and extensive in silica analyses to dissect important genetic components controlling these traits. Concurrently, we will deliver significant improvements in available genomic information and technologies for these species, thus having a lasting impact on European research capacity. Our work on genome resources will be undertaken in close collaboration with the International Sheep Genome Consortium and will make use of complementary resources provided by major research projects in Europe, Australasia, USA, Argentina and China.
3SR will provide selectable genetic markers that can be affordably applied by sheep and goat breeders to make important contributions to improving animal health, welfare, sustainability and the long-term competitiveness of small ruminant production in the EU. In addition 3SR will generate a collaborative infrastructure that will enable these orphan species to keep pace with the rapid developments in livestock genomics.
The group of Animal Breeding and Genetics of the department of Animal Production of the University of Le黑料不打烊 n participates in this project mainly through the analysis of a commercial population of Churra sheep for the detection and fine-mapping of genomic regions associated with mastitis resistance. This group also participates in the development of tools to model biological systems based on functional genomics data and structural genomics data.
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Contact: jjarrs@unileon.es
Area de investigaci黑料不打烊 n: KBBE-2009-1-1-02 (Uso) Extracci黑料不打烊 n de la informaci黑料不打烊 n gen贸mica en los peque帽os rumiantes para la identificaci黑料不打烊 n de la bases gen茅tica de fenotipos relacionados con sistemas productivos sostenibles y saludables
El proyecto 3SR (Sustainable Solutions for Small Ruminants) ha reunido un Consorcio Internacional 煤nico y de gran potencial que cuenta con 14 participantes cuyo objetivo ser谩 la obtenci黑料不打烊 n de una gran cantidad de informaci黑料不打烊 n gen贸mica de las especies ovina y caprina con lo que se espera que este proyecto represente un cambio en nuestra manera de interpretar y entender las bases gen茅ticas de los caracteres de inter茅s para la producci黑料不打烊 n saludable y sostenible de estas especies ganaderas. Con este objetivo, el proyecto se basar谩 en los recursos de 滨苍惫别蝉迟颈驳补肠颈贸苍 que ya se han desarrollado por parte de los pa铆ses de mayor producci黑料不打烊 n de ganado ovino y caprino, para identificar y verificar (en poblaciones comerciales) marcadores gen茅ticos, y si es posible mutaciones causales, que se puedan aplicar a los programa de selecci黑料不打烊 n para mejorar caracteres cr铆ticos para la cr铆a sostenible de ganado, principalmente en 谩reas productivas marginales. Los caracteres de inter茅s en relaci黑料不打烊 n a la producci黑料不打烊 n sostenible objeto de estudio en este proyecto son la susceptibilidad a la mastitis, resistencia a infecciones por nematodos y la tasa de ovulaci黑料不打烊 n. Todos estos son caracteres cuya mejora se ver铆a beneficiada sustancialmente por el uso de marcadores gen茅ticos (debido a su baja heredabilidad y dificultad de control rutinario) y para los cuales hay evidencias previas de que existen polimorfismos (variantes gen茅ticas?) que muestran efectos de magnitud considerable sobre la variaci黑料不打烊 n del car谩cter. El proyecto aplicar谩 las m谩s modernas tecnolog铆as de genotipado masivo, gen贸mica funcional y comparada, junto con la secuenciaci黑料不打烊 n gen贸mica de segunda generaci黑料不打烊 n y an谩lisis bioinform谩ticas (in silica) intensivos con el fin de identificar los componentes gen茅ticos m谩s relevantes que controlan los caracteres en estudio. Al mismo tiempo, se obtendr谩n mejoras significativas en relaci黑料不打烊 n a la informaci黑料不打烊 n y la tecnolog铆a gen贸mica disponible para las especies de inter茅s, lo que tendr谩 un gran impacto sobre el potencial investigador de Europa en este campo. El trabajo sobre recursos gen贸micos se llevar谩 a cabo en colaboraci黑料不打烊 n con el Consorcio Internacional del Genoma Ovino (International Sheep Genome Consortium) y har谩 uso de recursos complementarios proporcionados por grandes proyectos desarrollados en Europa, Australasia, USA, Argentina y China.
El proyecto 3SR proporcionar谩 marcadores gen茅ticos que puedan ser utilizados, a trav茅s de programas de selecci黑料不打烊 n, y de forma asequible, por los ganaderos de ovejas y cabras, contribuyendo as铆 a la mejora de la sanidad, el bienestar y la sostenibilidad de estos sistemas productivos, as铆 como a la competitividad a largo plazo de la producci黑料不打烊 n ganadera Europea de peque帽os rumiantes. Adem谩s, el proyecto 3SR generar谩 infraestructuras que permitir谩n que estas especies menores se vean beneficiadas de los grandes avances que est谩n teniendo lugar actualmente en el campo de la gen贸mica de las especies dom茅sticas.
El grupo de Mejora Gen茅tica Animal del Departamento de Producci黑料不打烊 n Animal de la 黑料不打烊 participa en este proyecto principalmente en lo relativo al an谩lisis de una poblaci黑料不打烊 n comercial de ganado ovino de raza Churra para la detecci黑料不打烊 n y mapeo fino de regiones gen贸micas asociadas con resistencia a la mastitis. Este grupo tambi茅n participa en el desarrollo de herramientas que tienen por objetivo modelar sistemas biol贸gicos basados en datos de gen贸mica funcional y gen贸mica estructural.
M谩s informaci黑料不打烊 n sobre el proyecto en
Contacto: jjarrs@unileon.es