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Research area: PEOPLE-2007-2-2.ERG Marie Curie Action: "European Reintegration Grants". Project title: High resolution mapping of a QTL region influencing fat percentage in Spanish Churra dairy sheep
Dairy sheep production in Mediterranean countries is based on the regional exploitation of a great variety of breeds, whose milk is processed into high quality cheese. The maintenance of these local breeds is strategically important from genetic diversity and environmental perspectives. Modern molecular genetics tools can be used to increase the efficiency of classic breeding programs in dairy sheep. Previously to the development of effective marker- or gene-assisted protocols, it is necessary to identify the genes controlling the production traits considered as selection targets.
This project will increase the density of genetic markers at a QTL region influencing milk fat percentage in a commercial population of Churra sheep, a Spanish indigenous breed highly specialized in milk production. Due to the similar efforts required for the analysis of other regions, the study of another QTL influencing milk protein percentage could be included, during the project progress, as an additional target QTL of this research. A combined linkage analysis and linkage disequilibrium analysis will subsequently be applied to refine the QTL positions, enabling the identification of positional and functional candidate genes included in the refined target QTL regions. The strongest candidate genes and also inter-genic regions will be characterised further by sequence analysis for SNP discovery. The allelic variants identified will then be tested for possible relationships with milk fat and protein percentages. This project will represent the first attempt to move genetic mapping in DAIRY sheep, from low-density linkage studies to high-density linkage disequilibrium and association methods.
The project will take advantage of the information derived from the latest release of the Bovine Genome sequence (comparative approach) and the Virtual Sheep Genome sequence. This is a novel approach to gene identification in dairy sheep, which has only just become possible with the increased available information on the sheep and cattle genomes. The successful fulfilment of the project objectives may lead to the implementation of molecular information into the classic breeding program currently running in the Churra population.
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Contact: jjarrs@unileon.es
Area de investigaci黑料不打烊 n: PEOPLE-2007-2-2.ERG. Acci黑料不打烊 n Marie Curie 鈥淧rograma de becas de Reintegraci黑料不打烊 n Europea鈥. T铆tulo del proyecto: Mapeo de alta resoluci黑料不打烊 n de un QTL para el porcentaje de grasa en la leche identificado en el ganado ovino de raza Churra
La producci黑料不打烊 n de ganado ovino lechero en los pa铆ses mediterr谩neos se basa en la cr铆a a nivel regional de una gran variedad de razas ovinas cuya leche se destina a la producci黑料不打烊 n de quesos artesanos de alta calidad. El mantenimiento de estas razas locales es de gran importancia estrat茅gica desde el punto de vista de la diversidad gen茅tica y del medioambiente. Hoy en d铆a existen herramientas de gen茅tica molecular que pueden utilizarse para incrementar la eficiencia de los programas de cr铆a y mejora cl谩sicos utilizados en ganado ovino lechero. Hay que tener en cuenta, sin embargo, que par el desarrollo de protocolos efectivos de selecci黑料不打烊 n asistida, r marcadores o genes, es necesaria la previa identificaci黑料不打烊 n de los genes que controlan los caracteres productivos objeto de selecci黑料不打烊 n.
Este proyecto se propone incrementar la densidad de marcadores gen茅ticos en una regi黑料不打烊 n cromos贸mica portadora de un QTL con influencia sobre el porcentaje de grasa en la leche, que fue previamente identificado en una poblaci黑料不打烊 n comercial de ganado ovino de raza Churra, una raza altamente especializada en la producci黑料不打烊 n lechera. Aprovechando el mismo dise帽o experimental, durante el desarrollo del proyecto, se puede incluir, como objetivo adicional, el estudio y mapeo fino de otro QTL identificado en la misma poblaci黑料不打烊 n para el porcentaje de prote铆na en la leche. Ade谩s de los an谩lisis de ligamiento cl谩sicos, se realizar谩 un an谩lisis de ligamiento combinado con an谩lisis desequilibrio de ligamiento, lo que permitir谩 acotar con mayor precisi黑料不打烊 n los intervalos de confianza de los QTL en estudio e identificar, dentro de las regiones gen贸micas redefinidas, genes candidatos posicionales y funcionales. Los candidatos m谩s prometedores, adem谩s de ciertas regiones interg茅nicas, ser谩n analizados mediante secuenciaci黑料不打烊 n con el objetivo de identificar polimorfismos, principalmente de tipo SNP. La posible relaci黑料不打烊 n de las variantes al茅licas identificadas con el porcentaje de grasa y prote铆na de la leche ser谩 posteriormente valorada mediante los correspondientes an谩lisis de asociaci黑料不打烊 n. Con respecto al ganado ovino de leche, este proyecto representa un primer intento de avanzar, a partir de un estudio cl谩sico de mapeo de baja densidad, hacia un estudio de alta densidad de marcadores basado en los m茅todos de desequilibrio de ligamiento y asociaci黑料不打烊 n.
El proyecto SheepMilkGenes se cimentar谩 en la informaci黑料不打烊 n gen贸mica derivada de la 煤ltima versi黑料不打烊 n de la secuencia del genoma bovino (mapeo comparado), y de la secuencia virtual del genoma ovino. En el campo de la gen茅tica del ganado ovino de leche, esta aproximaci黑料不打烊 n representa un m茅todo novel de identificaci黑料不打烊 n de genes candidatos, s贸lo posible de proponer por la disponibilidad de una creciente informaci黑料不打烊 n derivada de los proyectos de secuenciaci黑料不打烊 n de los genomas ovino y vacuno. La consecuci黑料不打烊 n exitosa de este proyecto podr铆a hacer posible que la informaci黑料不打烊 n molecular derivada del mismo se pudiera aplicar directamente al programa cl谩sico de mejora que se lleva a cabo en el ganado ovino de raza Churra.
M谩s informaci黑料不打烊 n sobre el proyecto en
Contacto: jjarrs@unileon.es