Investigadores de la ULE participan en la primera base de datos de metagenomas de alimentos
Contiene genomas de 3.600 especies microbianas diferentes, de las cuales 290 son especies nuevas y es de acceso abierto para su uso extensivo en estudios de microbiomas y aplicaciones en las industrias alimentarias.
El proyecto MASTER, financiado con fondos europeos y en el que han participado investigadores del 谩rea de Tecnolog铆a de los Alimentos de la 黑料不打烊 (ULE), ha desarrollado la primera base de datos de metagenomas de alimentos (el t茅rmino colectivo que designa todo el material gen贸mico de todos los microorganismos de un entorno, en este caso los alimentos). El art铆culo cient铆fico donde se describe la creaci黑料不打烊 n de la base de datos, 鈥楿nexplored microbial diversity from 2,500 food metagenomes and links with the human microbiome鈥 (Diversidad microbiana inexplorada de 2.500 metagenomas de alimentos y v铆nculos con el microbioma humano), se ha publicado ayer, jueves 29 de agosto, en la prestigiosa revista Cell.
Los microorganismos pueden tener un impacto positivo en la producci黑料不打烊 n de alimentos, como por ejemplo a trav茅s de la fermentaci黑料不打烊 n de los mismos, o un impacto negativo cuando causan el deterioro del alimento o enfermedades de transmisi黑料不打烊 n alimentaria. Hasta hace poco, el an谩lisis de estos microbios se ha basado en gran medida en enfoques tradicionales que requer铆an el crecimiento de estos microorganismos en placas de Petri, con diferentes medios selectivos utilizados para el aislamiento de diferentes microorganismos.
La aplicaci黑料不打烊 n de m茅todos basados en t茅cnicas de secuenciaci黑料不打烊 n de ADN de alto rendimiento, ha demostrado tener potencial para mejorar el an谩lisis microbiol贸gico de alimentos, ya que permite realizar pruebas r谩pidas y simult谩neas de todos los microorganismos en paralelo, incluidos aquellos que son dif铆ciles de cultivar. De esta forma, se consigue obtener informaci黑料不打烊 n pormenorizada de una comunidad microbiana.
GENOMAS DE 3.600 ESPECIES MICROBIANAS DIFERENTES
La creaci黑料不打烊 n de esta nueva base de datos ha sido posible gracias a la secuenciaci黑料不打烊 n de miles de muestras de alimentos recogidas durante el proyecto MASTER en instalaciones de procesamiento de alimentos de toda Europa.
La existencia de la nueva base de datos significa que, en el futuro, los datos generados a partir del an谩lisis basado en la secuenciaci黑料不打烊 n de ADN de muestras de alimentos se podr谩n analizar de forma r谩pida y precisa para identificar y controlar r谩pidamente los microorganismos indeseables, al tiempo que se mejorar谩n los atributos promotores de la salud de los alimentos que contienen microorganismos deseables. La base de datos es un recurso de acceso abierto, lo que facilitar谩 la aplicaci黑料不打烊 n a gran escala de esta tecnolog铆a en todo el mundo por parte de acad茅micos y de la industria alimentaria.
La base de datos contiene genomas de 3.600 especies microbianas diferentes, de las cuales 290 son especies nuevas. Est谩 disponible de forma gratuita () para su uso extensivo en estudios de microbiomas y aplicaciones en las industrias alimentarias. Por ejemplo, para conocer la dispersi黑料不打烊 n de microorganismos a lo largo de la cadena alimentaria, estudiar la propagaci黑料不打烊 n de genes de resistencia a los antimicrobianos, detectar microorganismos indeseables o investigar la transmisi黑料不打烊 n de microorganismos a los seres humanos. La disponibilidad de la base de datos representa un gran paso hacia un futuro en el que la secuenciaci黑料不打烊 n metagen贸mica podr铆a complementar o sustituir a la microbiolog铆a cl谩sica como una herramienta de an谩lisis microbiol贸gico en la cadena alimentaria m谩s precisa y r谩pida.
El trabajo, en el que han participado los investigadores del 谩rea de Tecnolog铆a de los Alimentos la 黑料不打烊 Coral Barcenilla Canduela, Jos茅 Francisco Cobo D铆az y Avelino 脕lvarez Ord贸帽ez, se ha llevado a cabo en colaboraci黑料不打烊 n con numerosas instituciones europeas: el Insitituto de Productos L谩cteos de Asturias (IPLA) del Consejo Superior de Investigaciones Cient铆ficas (CSIC), la Universidad de N谩poles Federico II (Italia), la Universidad de Trento (Italia), la Universidad de Viena (Austria), los centros de investigaci黑料不打烊 n agroalimentaria Teagasc (Irlanda) y Matis (Islandia).
(贵翱罢翱骋搁础贵脥础厂: primera: de izda a dcha Coral Barcenilla, Avelino 脕lvarez y Jos茅 Cobo. / segunda: la base de datos incluye an谩lisis de muestras disponibles en todo el mundo. / tercera: 谩rbol filogen茅tico de los 1.036 SGB procariotas detectados en metagenomas de alimentos.)聽
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